Recomenda-se instalar os gotejadores voltados para cima. Embora alguns acreditem que a instalação voltada para baixo ajude a água a chegar diretamente às raízes, a filtragem insuficiente pode fazer com que partículas se acumulem e obstruam os emissores. A instalação voltada para cima permite que o fluxo de água remova as impurezas, reduzindo significativamente o risco de entupimento.